Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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