Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms