Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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