Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CUL1Q13616 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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