Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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