Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CENPFP49454 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CENPFP49454 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CENPFP49454 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CENPFP49454 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CENPFP49454 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CENPFP49454 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CENPFP49454 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CENPFP49454 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CENPFP49454 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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