Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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