Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHACTR1Q9C0D0 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms