Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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