Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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