Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms