Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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