Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRGP23470 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRGP23470 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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