Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms