Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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