Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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