Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r25W4VSP2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r25W4VSP2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms