Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms