Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm4T1NXB5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms