Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Knop1Q9Z2Q2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms