Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubl3Q9Z2M6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubl3Q9Z2M6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ubl3Q9Z2M6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ubl3Q9Z2M6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ubl3Q9Z2M6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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