Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r17Q9Z2E4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms