Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpne6Q9Z140 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms