Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccl8Q9Z121 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccl8Q9Z121 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccl8Q9Z121 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccl8Q9Z121 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms