Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn2Q9Z0I6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms