Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gipc1Q9Z0G0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms