Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AireQ9Z0E3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AireQ9Z0E3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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