Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms