Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapaQ9WV55 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms