Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms