Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms