Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms