Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms