Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms