Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Trpc3Q9QZC1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc3Q9QZC1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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