Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms