Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms