Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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