Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms