Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms