Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3b2Q9JME5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b2Q9JME5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms