Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd2apQ9JLQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd2apQ9JLQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms