Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms