Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pole3Q9JKP7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms