Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms