Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddx20Q9JJY4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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