Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Sh3bgrlQ9JJU8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms