Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms