Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim39Q9ESN2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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