Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn10Q9ESK3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms